颜宁归国选择“梦都” 为何激荡舆论场？

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-7 18:08
欢迎信中这样写道，“尊敬的颜宁教授：欣闻您即将回国，参与创建深圳医学科学院，致力于我国医学科学事业 ...

颜宁发文回应离美归国

“行胜于言”，请再给我们一些时间

11月2日，颜宁@nyouyou 在微博平台发文对此进行回应。

颜宁在回应中表示，现在正是最忙碌的时候，“我们清华一直讲究'行胜于言'，请再给我们一些时间。”

颜宁称，关于接受深圳邀请，创建SMART的初心，她在十分钟的演讲里开篇就已经说过了，“扪心自问，我今日取得了一些成就，并不见得是因为我更聪明、更勤奋，在很大的程度上是因为过去二十几年我很幸运。”

此外，颜宁还称，SMART正处于创建之始，除了科研人员以外，还有各种岗位在招聘。

                               
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（来源：齐鲁晚报）

编辑：王煜玲

审核：周玉森

驻在平安夜前夕

因为颜宁，这地火了！资本闻风而动，“挤爆”了

2022-11-07 07:27:09 来源： 上海证券报 作者：黎灵希

　　本周，“女神”科学家颜宁即将全职回国创业的消息，迅速引起关注，也将深圳医学科学院的选址地——深圳坪山带入更多人的视线。

　　11月3日至4日在深圳坪山举行的2022深圳国际生物医药产业创新发展大会，便吸引了不少学者、产业人士以及投资人士参与，主会场座无虚席。

　　有参会的投资人表示，正是看到了颜宁准备回深创建深圳医学科学院的新闻，想来坪山实地了解这里的生物医药产业情况。

　　“深圳生物医药看坪山”

　　“深圳医学科学院，有关她的种种，不久会呈现在大家的面前。”宣布将辞职归国的第二天，颜宁在微博上发文回应了此事。

                               
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驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-7 18:09
因为颜宁，这地火了！资本闻风而动，“挤爆”了

2022-11-07 07:27:09 来源： 上海证券报 作者：黎灵希

　　此次颜宁计划回国创办的深圳医学科学院将按照全新机制的要求，主要建设“四平台一智库”，力争到本世纪中叶成为全球著名医学研究机构。

　　深圳医学科学院的选址地坪山，位于深圳东部，是深圳最年轻的行政区之一。近年来，“深圳生物医药发展看坪山”，正在逐步成为业界的共识。

　　聚焦生物创新药、高端医疗器械和生物技术三大细分领域，坪山区正着力打造上下游完整、特色鲜明、集群效应显著的生命健康产业集聚区。

　　在坪山区内，沿着锦绣中路向锦绣东路方向前行，一段不到4公里的路段上，汇聚了逾200家生物医药类公司以及11家上市公司，新产业、理邦仪器均位于此处。这条路因此被称为“BT（生物技术）大道”。

　　2022深圳国际生物医药产业创新发展大会的开幕式公布了一组数据，足以说明坪山生物医药产业蓬勃发展的态势——

　　目前，坪山区已汇聚赛诺菲巴斯德等近1000家生物医药企业，生物医药产业增加值占深圳全市比重达到15%以上，生产企业的数量占全市比重达25%以上。

　　同时，坪山区已拥有14个生物医药专业园区，同时有4个在建园区，预计到2025年还将新增492.2万平方米产业空间，可有力保障深圳发展生物医药产业集群的空间需求。

　　在2022深圳国际生物医药产业创新发展大会上，还有“深圳BioPark”全新亮相。

　　据介绍，“深圳BioPark”是深圳国家生物产业基地所在地，也是深圳生物医药产业发展核心园区和深圳生物医药产业核心集聚区，涵盖近500万平方米产业空间，真正实现生产、生活、生态“三生融合”。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-7 18:10
　　此次颜宁计划回国创办的深圳医学科学院将按照全新机制的要求，主要建设“四平台一智库”，力争到本世 ...

　　VC/PE机构看好坪山机遇

　　生物医药产业集聚效应日渐显著以及颜宁等知名科学家先后回归，也让坪山区受到了诸多VC/PE机构的关注。

　　“生物医药产业是深圳重点培育的产业集群，也是公司的一大投资方向。目前基石资本所投的新产业和英美达是坪山生物医药产业项目。”基石资本执行总裁王启文表示，这几年坪山区生物医药产业链日益完备，创业氛围浓厚，之后公司将继续保持密切关注，在坪山寻找一些生物医药的投资机会。

　　专注全球生物医药投资的倚锋资本，亦早已在坪山有所布局。在倚锋资本的投资案例中，既有科睿驰等办公地点位于坪山的企业，还有微芯生物等在坪山设有生产基地的企业。

　　倚锋资本董事长朱晋桥在2022深圳国际生物医药产业创新发展大会上分享了他对生物医药创新与投资的看法。朱晋桥表示，创新生物技术已经成为国内生物医药领域增长的动力来源。未来生物医药产业投资机会的四大核心要素为技术、政策、商业、资本化。

　　据悉，当前，深圳正加速推动生物医药相关资源、技术、产业的融合与发展，全力打造粤港澳大湾区“生物硅谷”。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-7 18:10
　　VC/PE机构看好坪山机遇
　　生物医药产业集聚效应日渐显著以及颜宁等知名科学家先后回归，也让坪 ...

　　根据今年6月印发的《深圳市人民政府关于发展壮大战略性新兴产业集群和培育发展未来产业的意见》，深圳将支持化学创新药、全新剂型及高端制剂、现代中药、先进制药设备以及数字化医疗等领域发展，推动新型基因治疗载体研发、工程细胞构建、抗体工程优化、人工智能辅助药物设计等瓶颈技术突破。

　　同时，深圳将加快宝龙生物药创新发展先导区、坪山生物医药产业加速器园区等项目建设，支持坪山、南山、福田、龙岗、光明和大鹏等区创建产业集聚区，推动生物医药产业集群成为产业发展新亮点。

　　在强化市级政策支持力度的前提下，坪山区印发了《深圳市坪山区关于加快科技创新发展的若干措施》《深圳市坪山区关于加快科技创新发展的若干措施实施细则》。当中重点针对生物、新能源、新一代信息技术和智能制造等领域，围绕创新链环节制定具体的支持政策，以进一步促进企业科技成果转化及产业升级。

驻在平安夜前夕

颜宁撰文谈与AI团队合作：真正的研究者都乐于拥抱技术进步

2022年11月11日 12:14 澎湃新闻

　　11月1日，在“2022深圳全球创新人才论坛”上，著名结构生物学家、美国国家科学院外籍院士颜宁宣布，将从普林斯顿大学辞职，加盟深圳医学科学院。颜宁“二次回国”的消息一经公布，便迅速成为热搜。

                               
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2022年11月1日，颜宁参加深圳全球创新人才论坛。人民视觉  资料图

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:14
颜宁撰文谈与AI团队合作：真正的研究者都乐于拥抱技术进步

2022年11月11日 12:14 澎湃新闻

　　澎湃新闻记者注意到，11月11日凌晨，颜宁通过个人微博@nyouyou 发文，针对近期一些相关话题作出回应。颜宁写道：“这两天有发自内心爱护我的师友总喊我辟谣，我真的很忙啊（忙到现在才瞜一眼微博，容易么我）。八竿子打不着、错漏百出、但凡花一个钟头读论文也不至于那么眼瞎的碰瓷文章，给眼神都浪费时间，为啥要我辟谣啊？有朋友想写澄清文章也被我拦了，好意心领了，但真犯不着。”

　　颜宁说：“去年8月8日，给了一个报告，讨论了AlphaFold的局限性；到今年的11月11日，发现去年的报告还是可以一张都不用改。简而言之，我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题（electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins），AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上，去年的预测达到了我们2017年的水平；今年依旧停留在我们2017年的水平（这里仅针对Nav/Cav）。在与专门做结构预测的AI团队合作，他们做预测我们做实验，测试新型小分子与蛋白的相互作用，迄今为止预测无一正确。”

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:15
　　澎湃新闻记者注意到，11月11日凌晨，颜宁通过个人微博@nyouyou 发文，针对近期一些相关话题作出 ...

　　“结构生物学不仅仅是看到Fold（折叠），更要理解蛋白质的动态变化，要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用，要理解在细胞原位里的状态，这些都是AI目前尚无能为力的领域，因为尚没有足够的数据库去训练它。举个例子，我们Cav2.2的结构去年发表晚了，尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练，所以它预测的模型就与实验结构严重不符。”

　　“真正的研究者都乐于拥抱技术进步，善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上，我期待AI越来越强大，如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现，那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。”颜宁表示说。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:15
　　“结构生物学不仅仅是看到Fold（折叠），更要理解蛋白质的动态变化，要理解与其他生物大分子或者 ...

　　最后，颜宁介绍说：“之前跟一个密友逗贫：做PI(principal investigator) 第一惨是想做实验没经费；第二惨则是大把启动经费才用一半就挥挥手要走了，不带走一叨乐。准备做PI的孩子们，记住在求职的时候，启动经费越多越好，因为那是你做科研最自由的fund。啥叫endowed chair （讲席教授）啊？这不只是个荣誉头衔，背后那是真金白银捐赠来的让你自由探索的经费，有这种不用写proposal的unrestricted fund，多想不开才非要申请NIH的啊（当然，还是要申请一两个嘛，否则我替闲人说：你看，申请不到吧）。”

　　此前，深圳媒体读创援引知情人士消息证实，账号@nyouyou 是著名科学家颜宁的微博账号。

　　对于“颜宁回国”登上热搜一事，“中国妇女报”微信公众号在11月7日刊文表示，这位中国最年轻的结构生物学家毅然决然地选择“回家”，实在是一件值得祝福期待的事，具有风向标意义。但和五年前离职赴美一样，颜宁回国也引发舆论热议，甚至出现了一些“非议”和“争议”。有人认为颜宁是“学术投机”，有人说“其心必异”。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:15
　　最后，颜宁介绍说：“之前跟一个密友逗贫：做PI(principal investigator) 第一惨是想做实验没经费； ...

　　“中国妇女报”微信公众号表示，但这种猜度并无实据。颜宁的科研人生高光不断，不满30岁便成为清华最年轻博导，42岁当选美国国家科学院外籍院士……她在国际学术舞台上留下了中国女性的闪亮篇章，也成为“曝光率”颇高的青年科学家。不喜欢待在“舒适区”的颜宁，选择回国接受“科研转化、学生培养”的新挑战，彰显一个科学家不断超越自我的职业精神，也是一个心怀梦想之人的勇敢探索。

　　文章认为，透过颜宁回国，也能真切地看到中国发展之势。如今的中国，科学研究的环境越来越好，科学创新的土壤越来越丰沃。党的二十大报告明确提出，深入实施科教兴国战略、人才强国战略、创新驱动发展战略。在这样的大背景下，相信会有越来越多的科学家心怀科研梦想，秉持家国情怀，投身到伟大事业中。

　　文章最后表示，我们常说，科学无国界，但科学家有国界。作为一名身在海外的科学家，心有梦想，立志在祖国的“星辰大海”奉献自己的智慧和力量，实在没啥可“争议”的。面对“颜宁们”的归来，我们欢迎且珍惜。

驻在平安夜前夕

颜宁回应研究方向正被AI取代：AI基于其科研数据进行预测

2022年11月11日 16:32 界面新闻

　　记者/李科文

　　编辑/谢欣

　　11月11日，颜宁在微博回应近期回国创办深圳医学院科学院，及其核心科研方向正被AI代替等相关话题。她表示，AI是基于其此前的研究解析数据基础上对人体蛋白质结构进行预测，期待AI越来越强大帮助生物科研工作者可以正儿八经地从化学角度研究生命起源。

　　颜宁还表示，充足的启动经费是科研人员在科学自由探索的基础，“第一惨是想做实验没经费；第二惨则是大把启动经费才用一半就挥挥手要走了。”

                               
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驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:16
颜宁回应研究方向正被AI取代：AI基于其科研数据进行预测

2022年11月11日 16:32 界面新闻

　　此外，颜宁还是回应称：此前在2022深圳全球创新人才论坛上，颜宁宣布，即将辞去普林斯顿大学教职，归国加盟深圳医学科学院。早在2017年，因选择离开任教10年的清华大学到普林斯顿大学就职，颜宁曾遭受不少争议。如今颜宁毫无征兆的宣布选择归国，再次引发网络热议，包括其主要研究方向是否已被人工智能代替等。

                               
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驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:16
　　此外，颜宁还是回应称：此前在2022深圳全球创新人才论坛上，颜宁宣布，即将辞去普林斯顿大学教职，归 ...

　　结构生物学是生物物理学的一个重要分支。该学科主要应用物理学的思想与研究方式，采用X射线晶体衍射、核磁共振、冷冻电镜成像等技术，精确解析蛋白质、核酸等生物大分子的三维结构及生物大分子之间的相互作用机制。研究这类问题的群体被称为结构生物科研工作者。颜宁便是其中的一员。她的主要研究领域为重要膜蛋白的结构与功能机理。

　　简而言之，许多像颜宁一样的结构生物学科研工作者，他们的日常工作便是帮助人类看清楚这些上述提及的构成生命活动基础的大分子以及它们那更加微小和复杂的空间结构。诺贝尔奖获得者费曼曾经半开玩笑地说，“许多基础的生物问题是非常容易解决的——只要能看到它们就行。”

　　近年来，随着英国的人工智能公司DeepMind发布的AlphaFold2，以原子水平的准确度预测了2/3的蛋白质结构，让非机构生物学专业的公众以为AI技术已能代替结构生物学科研工作者的工作。在知乎上，甚至还有人将AI技术AlphaFold2比喻为珍妮纺织机，而把结构科研工作者进行的结构生物学实验则喻为手工作坊。

　　颜宁表示，其专注于电压门控钠离子和钙离子通道几个关键问题（electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins）。AlphaFold在其团队过去解析的诸多结构的基础上，去年的预测达到了其团队2017年的水平；今年依旧停留在其团队2017年的水平（这里仅针对Nav/Cav）。在与专门做结构预测的AI团队合作，他们做预测其团队做实验，测试新型小分子与蛋白的相互作用，迄今为止预测无一正确。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:17
　　结构生物学是生物物理学的一个重要分支。该学科主要应用物理学的思想与研究方式，采用X射线晶体 ...

　　想理解颜宁回应文案的意思，便得首先得理解其所说的其专注的科研项目——电压门控离子通道是什么？电压门控离子通道是一大类位于细胞膜上、通过感受电信号控制离子跨膜进出细胞的蛋白质。

　　上世纪四五十年代，英国科学家霍奇金和赫胥黎发现了动作电位。之后，他们发现电压门控钠离子通道引发动作电位，而电压门控钾离子通道（Kv通道）则能使细胞去极化，恢复至静息电位。

　　电压门控离子通道目前是仅次于G蛋白偶联受体（GPCR）的第二大药物靶点。外科手术用到的麻醉剂通过抑制钠离子通道（Nav通道）起作用；钙离子通道（Cav通道）则是降压药物的靶点。因此，对于电压门控离子通道的研究尤其是结构生物学研究具有重要的生理学和药理学意义。

　　而钙离子（Ca2+）是生物体内重要的第二信使，在肌肉收缩、神经信号传递、腺体分泌、基因转录调控以及细胞凋亡等众多生命过程中扮演重要角色。一般情况下，细胞内的钙离子浓度远低于细胞外或者内质网中的钙库。

　　五十年代，科学家发现在没有钠离子的情况下，依赖钙离子也能产生动作电位，这是由电压门控钙离子通道介导的生理过程。电压门控钙离子通道响应细胞膜电位变化而激活，运输钙离子进入细胞，进而引发一系列下游信号通路。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:17
　　想理解颜宁回应文案的意思，便得首先得理解其所说的其专注的科研项目——电压门控离子通道是什么 ...

　　其中，Cav1.1（也叫dihydropyridine receptor，DHPR）是最早被鉴定出的电压门控钙离子通道，主要位于骨骼肌细胞的横小管（transverse tubule），是肌肉兴奋收缩偶联（excitation-contraction（E-C）coupling）过程中的关键蛋白。骨骼肌细胞在兴奋信号作用下会导致膜电位的变化，Cav1.1在感受膜电位变化后与肌质网膜上的RyR1蛋白发生相互作用，导致RyR1将肌质网中的钙离子快速大量释放到肌细胞质中，进而引起骨骼肌收缩。

　　据清华大学新闻网此前消息，2015年12月22日，颜宁在担任清华大学教授期间，其研究组在《自然》（Nature）杂志发表题为《电压门控钙离子通道复合物Cav1.1的三维结构》（Structure of the voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex）的研究论文，首次报道了真核生物电压门控钙离子通道的4.2埃分辨率的冷冻电镜结构，为理解其功能提供了重要的线索。

　　在此之前，虽然发现钙（钠）离子通道原核同源蛋白晶体结构，但它们的通道亚基是由四条相同的肽链组成的同源四聚体，并且没有辅助性亚基。因此为了更好地理解真核电压门控钙离子通道的结构与功能，诸多科研工作者一直致力于解析真核钙离子或钠离子通道的结构，但由于技术难度，此前只有低分辨（~20埃）的电镜结构。

　　根据上述颜宁2015年刊发的论文，其已经解析了肌肉兴奋收缩通路上的膜蛋白，包括电压门控钠离子通道（细菌同源蛋白NavRh）、电压门控钙离子通道、以及最大的钙离子通道RyR1的结构，从而为理解这一基本生理过程的分子机理打下重要基础。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:17
　　其中，Cav1.1（也叫dihydropyridine receptor，DHPR）是最早被鉴定出的电压门控钙离子通道，主要 ...

　　据清华大学新闻网，2016年9月1日，颜宁研究组又刊发《电压门控钙离子Cav1.1通道3.6埃分辨率结构》（Structure of the voltage-gated calcium channel Cav1.1 at 3.6 angstrom resolution）的研究长文（Research Article），报道了首个真核电压门控钙离子通道的近原子分辨率三维结构。

　　该研究报道的3.6埃电镜结构相比前述的4.2埃尽管在数字上看似进步不大，却有着质的飞越。在该结构中，大部分氨基酸的侧链能够被清晰分辨，从而可以据此搭建出准确和完整的结构模型。新的结构揭示了大量新信息，更新了科研工作者对电压门控钙离子通道的认识，

　　根据颜宁2016年刊发的论文，颜宁研究组已经成功解析了肌肉兴奋-收缩偶联通路上的两个关键膜蛋白Cav1.1以及RyR1的结构，从而为理解这一基本生理过程的分子机理打下重要的结构基础。也可以说，颜宁的科研成果为理解为数众多的具有重要生理和病理功能的电压门控钙离子和钠离子通道的工作机理奠定了基础。

　　实际上，结构生物学科研工作者的最终目标并不是将一个有一个蛋白结构观察出来，而是寻出自然规律利用氨基酸序列直接预测蛋白空间构象，而以AlphaFold2为代表的AI技术正是与前述两种实验手段相辅相成。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:18
　　据清华大学新闻网，2016年9月1日，颜宁研究组又刊发《电压门控钙离子Cav1.1通道3.6埃分辨率结构 ...

　　颜宁表示，结构生物学不仅仅是看到折叠（Fold），更要理解蛋白质的动态变化，要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用，要理解在细胞原位里的状态，这些都是AI目前尚无能为力的领域，因为尚没有足够的数据库去训练它。举个例子，其团队Cav2.2的结构去年发表晚了，尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练，所以它预测的模型就与实验结构严重不符。

　　一位生物医药人士曾向界面新闻表示，以AlphaFold2为代表的的AI蛋白结构预测算法，还没法取代结构生物学的湿实验。AI技术的确预测来几乎所有Uniprot（蛋白质序列与功能信息数据库）中的序列的结构，但这些预测模型的质量仍良莠不齐。

　　湿实验指的是在实验室里采用分子、细胞、生理学试验方法进行研究，也就是传统的药物研发实验室；而干实验则是通过计算机模拟及生物信息学方法来进行研究，也就是AI平台做的事情。

　　另一位生物医药人士也向界面新闻表示，AI只能是补充手段，可以减少确定结构过程中的很多麻烦，但最终仍脱离不开科研人员的实验验证。“即使你基于当前模型，预测的准确率达100%，也不能在不进行湿实验的情况下确定该结构的准确性。”

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:16
颜宁回应研究方向正被AI取代：AI基于其科研数据进行预测

2022年11月11日 16:32 界面新闻

离美归国因AI抢走饭碗？颜宁本人长文回应

2022-11-12 14:33:30    创事记 微博 作者： 量子位

                               
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　　文 | 杨净 詹士

　　来源：量子位

　　Alphafold不能取代结构生物学家！

　　刚决定离美归国不久的颜宁，再度发声。

　　事实上自她宣布“归去来兮”后，喧嚣与争议都没停过。

驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:19
离美归国因AI抢走饭碗？颜宁本人长文回应

2022-11-12 14:33:30    创事记 微博 作者： 量子位

　　这其中最匪夷所思的，就是关于回来原因的讨论——工作被AI替代了，所以在美国混不下去了。

                               
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驻在平安夜前夕

驻在平安夜前夕 发表于 2022-11-12 15:20
　　这其中最匪夷所思的，就是关于回来原因的讨论——工作被AI替代了，所以在美国混不下去了。

　　于是在深圳“忙到现在”的颜宁，终于给出回应：

Alphafold仍停留在我们5年前水平，与AI团队合作迄今预测无一正确。

　　还罗列出了各种目前AI在结构生物学还无能为力的方面。

　　不少网友表示：不懂这行，但听到颜老师这么说，就放心了。

                               
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