二、RNA测序的结果也不能反映基因组DNA的真实情况 倘若要说这项研究中最重要的涉及体内研究的部分,也就只有基于已发表的新冠患者的RNA测序数据所做的分析了。为了证明新冠病毒的RNA可能逆转录整合到感染细胞的基因组中,研究人员分析了已公开的受新冠病毒感染的细胞的RNA测序数据,发现人-新冠病毒嵌合RNA序列与病毒RNA的水平呈正相关(如下图)。而这却是这项研究中最不能用于支持论文结论的部分。 图注:来自已发表的感染新冠病毒的不同生物样本的RNA测序数据中,人-新冠病毒嵌合读数(Y轴)与新冠病毒总读数(X轴)的比值散点图 首先,我们要区分两个概念:RNA测序(RNA-Seq)和DNA测序(DNA-Seq)。RNA测序主要是在转录组(转录组是指在某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA等)范围内分析基因表达的方法,而DNA测序才是直接反映基因组序列的测序方法。RNA是由DNA转录而来,其水平当然可以反映DNA的一些情况,但是仅凭RNA测序的结果来评价基因组DNA是有失偏颇的。 这项研究中发现的人-病毒嵌合序列只能说是嵌合RNA产物,研究已经证实由于RNA测序的整个实验过程中包括了逆转录和PCR扩增的步骤,由相距甚远的基因组之间产生的嵌合RNA产物几乎都属于实验过程中的人工产物[2],因此,这并不能说明病毒的RNA逆转录整合到了细胞基因组中,更不能说明病毒数量越高整合的量越多。除非有DNA测序的结果,否则该研究中这唯一根据体内实验得出的结论可能只是实验误差。 综其两点,这项引发了谣言,并传播恐慌给大众的研究,其实只是提出了一个在实验室里观察到的现象,一不能反应真实体内情况,二不能表现真正基因组DNA结果。就连文章的作者本人也强调他们的研究结果并不意味着新冠病毒在人类细胞中建立了永久的遗传居住地[3]。 对于mRNA疫苗来说,一旦进入细胞内,唯一的行为就是履行它在核糖体中被合成蛋白质、产生免疫原性的职责。整合进人类基因组?仅凭这一个被封装在特殊载体中的、可编码特定蛋白质的mRNA根本做不到。人体内素来缺少处于激活状态的逆转录酶,即使存在,正如上文所述,人类基因组与新冠病毒基因组之间的整合尚不存在合理证据,mRNA疫苗中包裹的mRNA甚至不能被称为一个基因组。所以,就让谣言止于智者吧。 参考文献: 2. C Joel McManus, Michael O Duff, Jodi Eipper-Mains et al. Global analysis of trans-splicing in Drosophila. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jul 20;107(29):12975- 3. The coronavirus may sometimes slip its genetic material into human chromosomes—but what does that mean? https://www.sciencemag.org/news/2020/12/coronavirus-may-sometimes-slip-its-genetic-material-human-chromosomes-what-does-mean
|